Το Ρέικι βρίσκει εφαρμογή σε ατομικές θεραπευτικές συνεδρίες, σε θεραπείες εξ αποστάσεως, στον ενεργειακό καθαρισμό χώρων, σε μυήσεις (συντονισμούς με τα θεραπευτικά σύμβολα). Μπορεί να εφαρμοστεί επίσης σε συνδυασμό με άλλες εναλλακτικές μεθόδους, όπως τα αυστραλιανά ανθοϊάματα (ή τού Μπαχ), οι κάρτες αυτογνωσίας, η θεραπεία μέσω τής καλλιτεχνικής έκφρασης (art therapy), οι κρύσταλλοι, τα αιθέρια έλαια, η γιόγκα κτλ.

Επίσης, μπορεί να εξισορροπίσει την ενέργεια ζώων, φυτών, τροφίμων, φαγητού, φαρμάκων, εναλλακτικών θεραπευτικών παρασκευασμάτων, καλλυντικών, μηχανισμών κτλ.